Ülemaailmne loomaaedade strateegia seab loomaaedade kõige üldisemaks eesmärgiks looduskaitse. Kui oma tekkeaegadel olid loomaaiad pelgalt meelelahutust pakkuvad palaganiplatsid, siis nüüd arenevad nad kaasaegseteks looduskaitsekeskusteks, kus tegeletakse looduse säilitamise ja taastamisega.

Tallinna Loomaaed osaleb erinevates liigikaitse projektides. Üks erilisemaid missioone on Euroopa naaritsa (Mustela lutreola) säilitamine ja loodusesse tagasi viimine. EEP raames osaleb Tallinna Loomaaed veel mõnekümne liigi kaitses.